本課程主要是講述海洋沉積物中各種生地化現象、氧化還原反應及各元素於沉積物中之分佈及其控制因子。
海洋沉積物是自然界中物質重要的匯（sink），對於碳、氮、硫、氧、鐵、錳等元素之循環扮演了重要的角色。有機及無機物質埋藏至海洋沉積物後並非停止活動，而將會進行各種生地化反應，進而改變各元素之分布特性、濃度及分佈變化。海洋沉積物是經過長年累月不斷地沉降埋藏而來，故沉積物中有機及無機物質的變化亦反應了海洋環境時序性的改變，甚至反應了全球氣候及陸域環境的變遷。本課程期能提升學生們對於海洋沉積物之基本知識，使學生們瞭解海洋沉積物中各種生地化變化與反應機制，使學生們對於地球環境之變化有更深入的瞭解。
本課程使用Schulz and Zabel所編著的“Marine Geochemistry”為教科書，以深入淺出的方式，向學生們介紹：第1-2章「海洋沉積物的基本物理性質」、第3章「孔隙水化學組成及早期成岩作用」、第4章「有機物埋藏及其對沉積物生地化作用的影響」、第5章「地質微生物於生地化反應中扮演的角色」、第6章「沉積物氧、氮、磷元素之循環」、第7章「沉積物鐵的生地化反應」、第8章「硫循環及甲烷氧化反應」、第9章「碳酸鈣的生成及溶解」、第10章「穩定同位素的生地化變化」、第11章「錳核」、第13章「深海熱泉與冷泉」、第14章「天然氣水合物」。